Illumine 850K甲基化芯片介紹：
Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片（即850K芯片）是在450K芯片的基礎上，升級推出的新一版本的DNA甲基化芯片，這是一款更強大的甲基化圖譜分析工具。
850K芯片仍然保留了450k芯片中91%的位點，又增加了413,745個位點，總位點數為853,307個CpG位點。850K芯片在保留原有絕大多數CpG島，基因啟動子區位點的基礎上，主要增加了333,265個來自ENCODE及FANTOM5計劃的增強子區探針以及部分基因編碼區的探針。兼具全面的覆蓋范圍和高通量功能，850K芯片是EWAS研究的理想之選。
在探針設計上仍然使用Infinium I和Infinium II雙探針設計，Infinium I設計有兩種不同的探針，利用單堿基延伸原理U型磁珠尾部為A，用于檢測非甲基化位點；M型磁珠尾部為G，用于檢測甲基化位點。兩個探針的信號值用來區分甲基化的CpG位點和非甲基化的CpG位點的比例； Infinium II每個檢測位點只設計一個探針，通過比較該探針摻入的兩種熒光的信號值可以計算位點的甲基化比例。
Infinium I和Infinium II探針設計示意圖
Illumine 850K甲基化芯片特點：
· 全基因組覆蓋(853,307個CpG位點)
· 非CpG島位點覆蓋：
- 人類干細胞中非CpG甲基化位點（CHH位點）
- 腫瘤中差異甲基化位點
- FANTOM5增強子
- ENCODE開放染色質和增強子
- DNase超敏感位點
- miRNA啟動子區域
· FFPE樣本適用
· 實驗方法成熟，數據重復性好（98%技術性重復）
· 樣本起始量低，只需250ng
實驗流程：
樣本要求：DNA≥0.5μg，濃度≥50ng/μl；物種：人
