上海生物芯片有限公司
Shanghai Biochip Co., Ltd.
ATAC-SEQ測序技術介紹
ATAC-SEQ,全稱Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,即利用Tn5轉座酶結合到開放染色質上并酶切捕獲暴露的DNA序列,然后使用高通量測序技術對捕獲到的DNA序列進行建庫測序。
實驗流程
技術參數
推薦測序方式:illumina 測序平臺,PE150,建議至少10G/每個樣本
樣本要求:新鮮細胞,數量1x103—1x105個;新鮮組織,質量為50mg/份
建議對有參考基因組的物種進行ATAC-SEQ
核小體是由DNA和組蛋白形成的染色質基本結構單位。核小體再折疊最終形成高度壓縮的染色質結構。在復制和轉錄時高度折疊的染色質結構打開并暴露出DNA序列,這段DNA序列可被轉錄因子和其他調控原件結合,即染色質開放性。同時,這段裸露的DNA區域也是ATAC-SEQ需要研究的部分。
簡介
產品詳情
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